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７世紀前半に百済からの渡来人葛井氏の氏寺として創建された。1096(永長元)年に藤井安基という人物が葛井寺の荒廃している様子を嘆き伽藍の大修理に尽力したことからその姓をとって「藤井寺」という別名がつき、地名の「藤井寺市」もこれに由来すると言われている。西国三十三所第五番札所として多くの参拝者があり、境内の藤の美しさでも知られている。四脚門は桃山様式をよく伝える建造物として重要文化財に指定されている。