تأسست الحديقة عام ١٩٥٠ كمنشأة بحثية تابعة لكلية العلوم والتكنولوجيا بجامعة مدينة أوساكا، وسعت منذ ذلك الحين إلى جمع وحفظ العديد من النباتات كموضوع لبحوث نباتية أساسية. ركزت الحديقة تحديدًا على جمع الأشجار المحلية في اليابان، وزراعة أكثر من ٣٠٠ نوع من الأشجار التي يمكن زراعتها في الهواء الطلق، واستعادة أحد عشر نوعًا من الغابات النموذجية في اليابان. كما تعمل الحديقة على استعادة غابات النيوجين، التي تُعرف بأشجار الميتاسيكويا. وقد وُجد العديد من هذه الغابات في أوساكا سابقًا. ومن خلال رصد التطور طويل الأمد لهذه الغابات المُستعادة، تهدف الحديقة إلى توضيح العلاقة بين التغير البيئي والغطاء النباتي تجريبيًا.