كان الناسك هودو، القادم من تينجيكو (الهند حاليًا)، يؤدي طقوس الهيباتشي هنا، ووصلت قواها الخارقة إلى الإمبراطور تينشي آنذاك. ونتيجةً لذلك، تأسس معبد شيزوتاني-إن تشوفوكوجي في السنة التاسعة من حكم الإمبراطور تينشي (670) بأمر إمبراطوري. يُسمى الجبل الذي يُحفظ فيه الوعاء المستخدم في طقوس الهيباتشي التي يؤديها الناسك هودو هاتشيزوكاياما، ومنه اشتُق اسم المكان هاتشيغاميني. أما اسم المعبد "هودوجي" فيعود إلى أن الابن الأكبر لشوغون توكوغاوا الثامن، يوشيموني (الذي أصبح لاحقًا الشوغون التاسع، إيشيغي)، كان يُدعى ناغاتوميمارو، وقد أُعيدت تسمية المعبد إلى هودوجي لتجنب تشابه الاسمين. أما قاعة الطعام التي تعود إلى فترة كاماكورا، فهي مبنية ببساطة، وهي واحدة من مثالين فقط من هذا النوع في محافظة أوساكا. يحتوي الباغودا من فترة البلاط الشمالي والجنوبي على طابق علوي على الطراز الصيني وطابق سفلي على الطراز الياباني، والجزء العلوي يحتوي على إطار خشبي منحوت يسمى شوثيجيكي، ويقال إنه أقدم مثال على هذا النوع.