أُعيد افتتاح المتحف في أغسطس 2007، ويقع في مبنى ماشيكانياما شوغاكوكان، الذي اكتمل بناؤه عام 1931. يقوم مفهوم المتحف على مفهوم "المتحف التفاعلي"، الذي يُبرز كيفية ارتباط أبحاث الجامعة وتقاليدها بالمجتمع من خلال التبادل الثقافي. يعرض المتحف حاليًا ما يقرب من 600 عينة أكاديمية، أبرزها واحدة من أكبر حفريات التماسيح في العالم. استُخرج هذا التمساح، الذي عاش في أوساكا قبل حوالي 500 ألف عام، من موقع بناء الحرم الجامعي. يعرض الطابق الثاني مواد تتعلق بجذور الجامعة، كايتوكدو وتيكيجوكو. أسس سكان المدينة كايتوكدو خلال فترة إيدو، ولعب دورًا رئيسيًا في نشر الثقافة الأكاديمية في أوساكا بين عامة الناس. أسس أوغاتا كوآن تيكيجوكو، ودرس فيه العديد من الشباب، بمن فيهم فوكوزاوا يوكيتشي، الذين ساهموا فيما بعد في رسم ملامح فجر الثقافة اليابانية الحديثة. يُعرض أيضًا أول مجهر إلكتروني محلي الصنع، طُوّر عام ١٩٣٩، وأول نموذج ثلاثي الأبعاد لبنية بروتينية في اليابان، والذي أجرته جامعة باستخدام الأشعة السينية. تُثبت هذه المعروضات أن جامعة أوساكا كانت رائدة في أبحاث الضوء والإلكترونات. تحتفظ جامعات أخرى بأكثر من ١٫٦ مليون عينة أكاديمية مخزنة، ويجري العمل على خطط لإتاحتها تدريجيًا للجمهور مع ابتكار طرق جديدة لعرضها.