Además de la sala principal, declarada Bien Cultural Importante de Japón, el Santuario Funamori también cuenta con una sala de culto, una sala de ofrendas sagradas, un escenario y un santuario portátil. Aún se desconocen los detalles de su fundación. Dentro del recinto del santuario, un alcanforero de forma inusual, compuesto por cuatro troncos fusionados, está consagrado como árbol sagrado. Este árbol tiene aproximadamente 800 años y ha sido declarado monumento natural de la prefectura.