El Templo Shinganji fue fundado a finales del período Azuchi-Momoyama, durante la era Bunroku, bajo el mando de Toyotomi Hideyoshi. Sin embargo, fue demolido tras el Asedio de Invierno de Osaka y reconstruido en 1622 con la ayuda del clan Unno, ancestros del clan Sanada, en el emplazamiento de su campamento del Asedio de Invierno de Osaka (Sanadamaru) como monumento conmemorativo a Sanada Yukimura y su hijo, Daisuke. En los alrededores del Templo Shinganji, el famoso general Sanada Yukimura (también conocido como Sanada Saemonsa Toyotomi Nobushige) construyó un fuerte llamado Sanadamaru al sureste del Castillo de Osaka, en la Meseta de Kamimachi, donde las fuerzas de Toyotomi quedaron vulnerables, y lo utilizó para defenderse del enemigo durante el Asedio de Invierno. Además, el templo cobró mayor relevancia tras la participación de varios miembros de la División de Patrulla de Kioto, entre ellos Katsura Sanosuke, Watanabe Kichitaro y Takahashi Yasujiro, en el ataque a la Casa Omiya en Kawaramachi, Kioto, en 1867, en el que fueron asesinados Sakamoto Ryoma y Nakaoka Shintaro. Miembros de la Mimawarigumi también participaron en la Batalla de Toba-Fushimi y murieron en combate. Fueron enterrados en el Templo Shinganji, donde aún se conservan sus tumbas.