En 1596, Kyonyo, el duodécimo sacerdote principal del templo Honganji, construyó el templo Otani Honganji en Watanabe, y en 1598 se trasladó a su ubicación actual. Fue el templo principal de la rama Otani del budismo Shinshu hasta la construcción del templo Higashi Honganji en Kioto en 1594. Fue destruido por un incendio en 1945 y reconstruido en 1961. En los terrenos del templo hay un monumento con el último poema de Matsuo Basho grabado. Junto con Tsumura Betsuin (un templo filial de Kitamido y Nishi Honganji), es el origen del nombre Midosuji.