Se dice que fue fundado en el decimoctavo año del reinado del emperador Suinin (12 a. C.). En la antigüedad, la zona circundante se llamaba "colina Tamatsukuri" y albergaba a los Tamakuribe, un grupo de artesanos que fabricaban magatama (cuentas con forma de coma), lo que dio origen al nombre actual de Tamatsukuri. Durante los períodos Toyotomi y Tokugawa, era conocido como la deidad guardiana del Castillo de Osaka, y se dice que Toyotomi Hideyoshi, Hideyori y Yodo-dono (invitadas) celebraban aquí ceremonias del té, con Sen no Rikyu como maestro. El Santuario Toyokuni fue completamente destruido por un incendio durante la guerra civil de 1576, la posterior caída del Castillo de Osaka y los bombardeos de la Segunda Guerra Mundial. El edificio actual del santuario fue reconstruido después de la guerra. El recinto del santuario incluye una puerta torii donada por Hideyori y un monumento en conmemoración de Sen no Rikyu. El Museo Naniwa Tamatsukuri también alberga valiosas exhibiciones, incluidos antiguos artefactos de jade, la historia del jade y el proceso de fabricación del jade, y cerámica antigua.