On ignore la date de sa fondation. À l'origine, le sanctuaire se trouvait à l'est du gouffre de Shimo-Kanda, face à la divinité locale de Shimazume, anciennement Shinomiya Murakami (aujourd'hui Kadoma), de l'autre côté de la rivière. Pendant le festival de Shimazume, des offrandes de gohei étaient reçues du sanctuaire de Kanda, puis ramenées à ce dernier après les festivités. En 1659, il fut installé à son emplacement actuel. La légende raconte que si du saké sacré est offert à Michizane Sugawara, dont la statue se trouve dans le sanctuaire, pendant le festival annuel, son visage deviendra rouge. Dans l'enceinte du sanctuaire se dresse un grand camphrier de plus de 800 ans, avec un tronc de 10 mètres de circonférence et une hauteur d'environ 30 mètres.