Le Musée préfectoral de la culture Yayoi d'Osaka collecte, conserve et expose des objets et des informations relatifs à la culture Yayoi en général. Dans la première salle d'exposition, intitulée « Visualiser la culture Yayoi », les visiteurs traversent une zone d'introduction présentant une habitation semi-enterrée grandeur nature et une carte représentative de la période Yayoi à travers le Japon. Ils peuvent ensuite découvrir la culture de cette période, considérée comme la « source de la culture japonaise », à travers six sections : « Les débuts de la riziculture », « La naissance des nouvelles technologies », « Village, guerre et pays », « Le peuple Yayoi », « Interactions » et « Mort et fêtes ».
De plus, en tant que « musée où l'on peut rencontrer Himiko », une zone symbolique liée à Himiko, la reine de Yamataikoku, a été aménagée au centre de la salle d'exposition.
La seconde salle d'exposition, « Le Monde d'Ikegami Sone », est un musée adjacent aux ruines d'Ikegami Sone, site historique classé et l'un des vestiges majeurs de la période Yayoi au Japon. Elle présente les ruines. Parmi les pièces exposées figurent les piliers d'un grand édifice, également appelé sanctuaire, et la réplique d'un puits creusé de très grande taille, permettant aux visiteurs de se faire une idée de l'aspect du site à cette époque.
La salle d'exposition temporaire accueille des expositions permanentes et temporaires qui présentent l'histoire et la culture de la période Yayoi sous différents angles à chaque saison. Dans l'espace extérieur aménagé, vous pouvez participer aux fouilles et à la restauration d'une habitation semi-enterrée.
Il s'agit du seul musée spécialisé du pays qui permet aux visiteurs de se familiariser avec la culture Yayoi en général, et pas seulement avec les ruines locales. Le parc historique d'Ikegami Sone, situé au nord du musée, abrite de grands bâtiments restaurés et le centre d'apprentissage Yayoi d'Ikegami Sone, où les visiteurs peuvent découvrir l'artisanat de l'époque Yayoi.