1950년에 연구 시설로서 출범한 이래 식물의 수집과 보존에 힘써, 약 25.5ha 규모의 식물원에서 약 6,000종류, 30,000그루나 되는 식물을 키우고 있다. 그중에서도 일본산 수목 수집에 주력하여, 일본의 대표적인 숲 11종을 복원 전시하고 있다. 또한, 멸종 위기인 식물의 육성에도 힘을 쏟고 있다. 이코마 산계의 평탄한 경사지에 위치한 식물원 안에는 능선 4개와 골짜기 3개가 있으며 일본산 수목 견본원과 메타세쿼이아를 감상할 수 있는 외국산 수목원, 화목원 및 대나무와 작은 대나무원, 건조지의 식물을 모은 사막원, 휴게실 등을 갖추고 있다. 봄에는 벚꽃 약 300그루, 여름에는 무궁화와 부용, 가을에는 싸릿속과 물푸레나무, 겨울에는 약 600그루의 참죽나무와 100그루의 매화나무에 꽃이 피어, 사계절마다 각기 다른 경치를 즐길 수 있다.