1931년에 준공된 복고풍 건물을 이용하여 2007년 8월에 리뉴얼 오픈. 박물관의 컨셉은 ｢교류형 뮤지엄｣. 교류를 통하여 대학 연구나 전통이 어떤 식으로 사회와 연결되어 있는지를 사람들에게 알리고 있다.현재는 약 600점의 학술 표본 자료가 전시되어 있으며, 그 중에서도 가장 유의해서 볼 것은 세계 최대급의 ｢악어 화석」. 약 50만년 전 오사카에 생식하던 것으로, 대학 캠퍼스의 건축 현장에서 출토된 화석이다.2층에는 대학의 기원이 된 ｢카이토쿠도｣와 ｢테키쥬쿠｣에 관한 자료를 전시하고 있다. 카이토쿠도는 에도시대 상인들이 창설한 것으로 오사카의 학문적 토양을 널리 일반 시민에게까지 뿌리를 내리는 데 큰 역할을 수행하였다. 테키쥬쿠는 오가타 코안이 창설하였으며, 후쿠자와 유키치를 비롯한 일본 근대 문화의 여명기를 구축한 젊은이들이 이곳에서 공부하였다.또한, 1939년에 개발된 국산 제1호 전자현미경을 전시하고 있으며, X선을 사용하여 본 대학에서 실시한 일본 최초의 단백질 구조에 대한 입체적 모형이 표현되어 있다. 이들 전시는 오사카대학이 빛과 전자에 관한 연구로 시대의 최첨단을 달리고 있다는 사실을 증명해 준다.기타 대학에서는 160만 점이 넘는 학술표본자료가 보존되어 있으며, 전시 방법 등을 고려하며 순차적으로 공개할 예정이다.