利用1931年竣工的待兼山修学馆，于2007年8月重装开业。博物馆的概念是“交流型博物馆”。通过交流传播大学的研究和传统如何与社会联系。现在展示着约600件的学术标本资料，其中最引人注目的是世界最大级的“鳄鱼化石”。它大约50万年前居住在大阪，它是从大学校园建筑工地出土的。2楼展示着作为大学的起源的“怀德堂”和“适塾”相关的资料。怀德堂在江户时代由町人创建，发挥了将大阪的学术土壤广泛地扎根于普通市民的作用。私塾由绪方洪庵创办，以福泽谕吉为首的开创了日本近代文化黎明期的年轻人曾在这里学习。此外，1939年国内1号电子显微镜的展览和我国上第一个使用X射线的蛋白质结构的三维模型。这些展览证明了大阪大学在光和电子研究方面走在了时代的最前沿。其他大学保存了160万多个学术标本材料，并计划在设计展览方法等的同时按顺序发布。