利用1931年竣工的待兼山修學館，於2007年8月重裝開業。博物館的概唸是“交流型博物館”。通過交流傳播大學的研究和傳統如何與社會聯係。現在展示著約600件的學術標本資料，其中最引人註目的是世界最大級的“鱷魚化石”。它大約50萬年前居住在大阪，它是從大學校園建築工地出土的。2樓展示著作為大學的起源的“懷德堂”和“適塾”相關的資料。懷德堂在江戶時代由町人創建，發揮了將大阪的學術土壤廣泛地扎根於普通市民的作用。私塾由緒方洪庵創辦，以福澤諭吉為首的開創了日本近代文化黎明期的年輕人曾在這裡學習。此外，還展示了1939年開發的國內1號電子顯微鏡，以及由大學利用X射線進行的我國第一個蛋白質結構的三維模型。這些展覽證明了大阪大學在光和電子研究方面走在了時代的最前沿。其他大學保存了160萬多個學術標本材料，並計劃在設計展覽方法等的同時按順序發佈。