呢個博物館喺2007年8月翻新同重新開放，利用咗1931年完工嘅町金山研究館。博物館嘅概念係一個「互動博物館」，傳達大學嘅研究同傳統係點樣透過互動同社會連結。目前，大約有600個學術標本同材料展出，其中最亮點係世界上最大嘅「鱷魚化石」之一。呢個化石大約42萬年前喺大阪生活，係喺大學校園嘅建築工地發掘出嚟。喺二樓，展示咗同大學嘅根源「開德堂」同「鐵宿」有關嘅材料。開德堂係由江戶時代嘅鎮民創立，喺建立大阪喺一般市民中嘅學術基礎方面發揮咗作用。鐵宿係由大形公安創立，建立現代日本文化黎明嘅年輕人，包括福澤由吉，都喺嗰度讀書。另外，博物館展出咗1939年開發嘅第一個國產電子顯微鏡，同埋日本第一個蛋白質結構嘅三維模型，呢個模型係由大學用 X 射線創造出嚟。呢啲展品證明咗大阪大學係光同電子研究嘅最前線。其他大學亦都保存咗超過160萬份學術樣本同材料，並計劃逐步向公眾提供，並以創新嘅展示方法同其他功能。