延歷6年 (787年)，桓武天皇在長岡京以南的地方設置郊祀壇，以祭祀父親光仁天皇。據說這是效仿中國皇帝每年冬至在都城南邊設立天壇祭祀天帝的例子。正殿是一間社流造，是鐮倉時代的嘉禎4年 (1238年) 和室町時代的應永8年 (1401年) 修復的。外觀保留了鐮倉時代的風格，駝峰等雕刻纖細美麗，與旁邊的末社八幡神社正殿都是國家重要文化遺產。在交野天神社前殿的裡面，登上石階就是貴船神社的末社，據說是6世紀時繼體天皇放置的樟葉宮遺跡。