พิพิธภัณฑ์วัฒนธรรมยาโยอิจังหวัดโอซาก้า รวบรวม อนุรักษ์ และจัดแสดงวัสดุและข้อมูลที่เกี่ยวข้องกับวัฒนธรรมยาโยอิโดยทั่วไป ในห้องนิทรรศการแรก ภายใต้หัวข้อ "Visualizing Yayoi Culture" ผู้เข้าชมจะผ่านโซนแนะนำที่จัดแสดงบ้านหลุมขนาดเท่าคนจริงและแผนที่ตัวแทนของยุคยาโยอิจากทั่วประเทศ และจะได้เรียนรู้เกี่ยวกับวัฒนธรรมของยุคยาโยอิ ซึ่งเป็น "ต้นกำเนิดของวัฒนธรรมญี่ปุ่น" ผ่าน 6 ส่วน ได้แก่ "จุดเริ่มต้นของการเพาะปลูกข้าว" "กำเนิดเทคโนโลยีใหม่" "หมู่บ้าน สงคราม และประเทศ" "ชาวยาโยอิ" "ปฏิสัมพันธ์" และ "ความตายและเทศกาล"
นอกจากนี้ เพื่อเป็น "พิพิธภัณฑ์ที่คุณจะได้พบกับฮิมิโกะ" ยังได้จัดตั้งโซนสัญลักษณ์ที่เกี่ยวข้องกับฮิมิโกะ ราชินีแห่งยามาไทโกกุ ไว้ตรงกลางห้องนิทรรศการอีกด้วย
ห้องนิทรรศการที่สอง “โลกอิเคกามิ โซเนะ” เป็นพิพิธภัณฑ์ที่อยู่ติดกับซากปรักหักพังอิเคกามิ โซเนะ ซึ่งเป็นโบราณสถานแห่งชาติและเป็นหนึ่งในซากปรักหักพังยุคยาโยอิชั้นนำของญี่ปุ่น จัดแสดงซากปรักหักพังเหล่านี้ นิทรรศการประกอบด้วยเสาของอาคารขนาดใหญ่ หรือที่รู้จักกันในชื่อศาลเจ้า และแบบจำลองบ่อน้ำขนาดใหญ่พิเศษที่มีลักษณะเป็นโพรง ซึ่งช่วยให้ผู้เข้าชมเข้าใจสภาพของฐานที่ตั้งในยุคนั้น
ห้องนิทรรศการพิเศษจัดแสดงนิทรรศการพิเศษและนิทรรศการที่วางแผนไว้ ซึ่งนำเสนอประวัติศาสตร์และวัฒนธรรมของยุคยาโยอิจากมุมมองที่หลากหลายในแต่ละฤดูกาล ในส่วนประสบการณ์กลางแจ้ง คุณจะได้สัมผัสกับการขุดค้นและบูรณะบ้านเรือนในหลุม
เป็นพิพิธภัณฑ์เฉพาะทางแห่งเดียวในประเทศที่ให้ผู้เยี่ยมชมได้คุ้นเคยและเรียนรู้เกี่ยวกับวัฒนธรรมยาโยอิโดยทั่วไป ไม่ใช่แค่ซากปรักหักพังในท้องถิ่นเท่านั้น อุทยานสถานที่ประวัติศาสตร์ Ikegami Sone ตั้งอยู่ทางทิศเหนือของพิพิธภัณฑ์ มีอาคารขนาดใหญ่ที่ได้รับการบูรณะ และเป็นที่ตั้งของศูนย์การเรียนรู้ Ikegami Sone Yayoi ซึ่งผู้เยี่ยมชมสามารถสัมผัสกับงานฝีมือในยุคยาโยอิได้