แม้จะไม่ทราบวันที่ก่อตั้ง แต่ศาลเจ้าแห่งนี้มีประวัติศาสตร์อันยาวนาน รู้จักกันในชื่อมิยามะ หรือ อาโอกาคิยามะ ซึ่งได้รับการเคารพบูชาในฐานะภูเขาศักดิ์สิทธิ์มายาวนาน ถัดจากศาลเจ้าคือวัดโคเซนจิของนิกายเทนได ซึ่งสร้างขึ้นโดยจิคาคุ ไดชิ (เอ็นนิน) ในปี ค.ศ. 852 (ปีที่สองของยุคนินจา) และศาลเจ้าแห่งนี้ยังคงรักษาร่องรอยของการผสมผสานระหว่างศาสนาชินโตและพุทธศาสนาที่สืบทอดกันมาอย่างยาวนานตั้งแต่สมัยโบราณจนถึงยุคเอโดะ ในปี ค.ศ. 1574 (ปีที่สองของยุคเท็นโช) ศาลเจ้าถูกเผาทำลายในช่วงสงครามของโอดะ โนบุนางะ แต่ศาลเจ้าได้รับการสร้างขึ้นใหม่พร้อมกับวัดโคเซนจิในช่วงยุคเก็นโรคุของยุคเอโดะ ทุกๆ ปีในวันที่ 5 พฤษภาคม จะมีการจัดงานเทศกาลอันยิ่งใหญ่โดยมีศาลเจ้าเคลื่อนที่