ศาลเจ้าคุซุโมโตะเป็นหนึ่งในสามศาลเจ้าคุซุโมโตะที่ปรากฏในบันทึกเอนกิชิกิ และไม่ทราบวันที่ก่อตั้ง กล่าวกันว่าในรัชสมัยจักรพรรดิโยเมอิ โมโนโนเบะ โมริยะ ได้ประดิษฐานฟุสึโนะโนะโอคามิไว้เป็นเทพผู้พิทักษ์ปราสาทอินามูระ ซึ่งเป็นฐานของศาลเจ้า และเป็นบรรพบุรุษของตระกูล ศาลเจ้าแห่งนี้เป็นที่เคารพนับถือของชาวบ้านอย่างกว้างขวางในฐานะเทพเจ้าแห่งการเกษตรและสงคราม รวมถึงเป็นเทพเจ้าผู้ขับไล่วิญญาณชั่วร้าย ปกป้องคุ้มครองจากโรคภัยไข้เจ็บและการฟื้นฟู มีการจัดเทศกาลประจำเดือนในวันที่ 1 และ 15 ของทุกเดือน